Système de collecte et de préservation de l'acide nucléique des selles
Système tout-en-un pour la collecte, la conservation, l'expédition et le stockage rapides et simples d'échantillons de selles.
Système de collecte et de préservation de l'acide nucléique des selles
Système tout-en-un pour la collecte, la conservation, l'expédition et le stockage rapides et simples d'échantillons de selles.
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Aperçu du produit
Le système de collecte et de préservation des acides nucléiques des selles de Norgen est un système complet conçu pour la collecte, le stockage à température ambiante et le transport des acides nucléiques des échantillons de selles. Chacune des 50 coquilles contient : des gants en nitrile, des tampons d'alcool, du papier de collecte Fe-Col® et le tube Norgen de collecte et de préservation de l'acide nucléique des selles contenant le conservateur Norgen de selles sous forme liquide. L'utilisateur recueille simplement l'échantillon de selles à l'aide du papier de collecte Fe-Col® fourni, puis transfère les selles dans le tube de collecte et de conservation de l'acide nucléique des selles à l'aide de la cuillère fixée sur le couvercle. L'échantillon est ensuite mélangé doucement jusqu'à ce que les selles soient bien immergées dans le conservateur. Le conservateur de selles élimine la nécessité de traiter ou de congeler immédiatement les échantillons et permet d'expédier les échantillons à des installations d'analyse centralisées à des températures ambiantes. Les composants du conservateur de selles permettent de conserver les échantillons à température ambiante pendant plus de 2 ans pour l'ADN et jusqu'à 7 jours pour l'ARN. Pour prolonger la stabilité de l'ARN des selles dans le conservateur, il est recommandé de le conserver à -20°C ou -70°C dès son arrivée au centre d'analyse jusqu'à la purification de l'ARN. Le conservateur de selles empêche également la croissance des bactéries et des champignons Gram négatif et Gram positif, et inactive les virus, ce qui permet de manipuler et d'expédier en toute sécurité les échantillons non infectieux qui en résultent.
Détails
Données justificatives
Figure 1. La meilleure préservation de Norgen.Résumé des changements de communauté en réponse aux solutions stabilisantes sur une période de stockage de 14 jours. Distance de Bray-Curtis par rapport à la référence pour chaque patient regroupé par solution stabilisante. La médiane et les intervalles du 5ième au 95ième percentile sont indiqués pour la variabilité interaliquote et entre les patients (adapté de Plauzolles et al, 2022). Norgen est la méthode la plus proche des échantillons de selles congelés, parmi 11 autres méthodes de collecte et de conservation d'échantillons.
Figure 2. Intégrité de l'ADN et de l'ARN totaux des selles isolés à partir d'échantillons de selles conservés.L'ADN et l'ARN ont été isolés à partir de 200 µL de selles conservées de 4 donneurs différents (voies A à D) stockées à température ambiante aux moments indiqués (ADN à 27 mois et ARN à 7 jours) à l'aide du kit d'isolation de l'acide nucléique des selles de Norgen (Cat. #45600). Ensuite, 10 µL des 75 µL d'acide nucléique élué ont été chargés sur un gel pour une analyse visuelle. L'ADN de selles à haute intégrité a été isolé à partir d'échantillons de selles conservés à température ambiante pendant 27 mois, et l'ARN à haute intégrité a été isolé à partir d'échantillons de selles conservés pendant 7 jours à température ambiante. La voie M est une échelle d'ADN HighRanger 1 kb de Norgen (Cat. #11900).
Figure 3. Surveillance de la stabilité de l'ADN de l'adénovirus (Ad5subE1) ajouté à des échantillons de selles conservés à l'aide du test PCR en temps réel TaqMan. Des échantillons de selles conservés ont été enrichie avec 6 x 109 pfu/mL d'adénovirus, et 200 µL d'échantillons ont été prélevés aux moments indiqués. L'ADN des selles a ensuite été isolé à l'aide du kit d'isolement de l'ADN des selles de Norgen (Cat# 27600). Ensuite, 2 µL d'ADN matrice provenant de chaque 50 µL d'élution ont été utilisés dans une réaction PCR de 20 µL pour détecter l'ADN de l'adénovirus. Il a été démontré que le conservateur de selles stabilise l'ADN de l'adénovirus jusqu'à 21 semaines à température ambiante, ce qui indique que les tubes de prélèvement et de préservation de l'acide nucléique des selles de Norgen constituent un système de transport d'échantillons sûr et pratique.
Figure 4. Regroupement hiérarchique des échantillons de selles au niveau du phylum dans différentes conditions de stockage. La composition microbienne des échantillons de selles conservés dans les tubes de prélèvement et de préservation de l'acide nucléique des selles de Norgen (Cat. 45630, 45660) ne diffèrent pas significativement de ceux des témoins (selles fraîches du jour 0 à la RT) sur une période de 2 jours, tandis que les échantillons de selles non conservés ont montré une distance dans le dendrogramme par rapport au profil original des selles.
Figure 5. Différence dans les 5 principaux micro-organismes abondants au niveau de l'embranchement par rapport aux selles fraîches (jour 0). L'abondance des Firmicuties, des Bacteroidetes et des protéobactéries de l'échantillon de selles conservé était plus élevée que celle des selles fraîches non conservées (NP) après 2 jours de stockage à température ambiante, ce qui indique que l'originalité du profil des micro-organismes de l'échantillon conservé est beaucoup plus proche de celle de l'échantillon de selles fraîches (jour 0).
Figure 6. Abondance relative des genres bactériens entre les échantillons de selles conservés et non conservés à température ambiante pendant 2 jours. Préserver l'échantillon de selles en utilisant les tubes de prélèvement et de préservation de l'acide nucléique de Norgen (Cat. 45630, 45660) ont montré une relativité proche de l'échantillon de selles fraîches (jour 0).
Figure 7. Corrélation entre les lectures métagénomiques bactériennes en double utilisant (A) des selles fraîches (jour 0) et des selles conservées à la température ambiante pendant 2 jours et (B) des selles fraîches (jour 0) et des selles non conservées à la température ambiante pendant 2 jours. Un R2 plus important a été observé pour les selles fraîches (jour 0) et les selles conservées, ce qui suggère une plus grande cohérence entre les échantillons de selles fraîches et les échantillons de selles conservées.
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Spécifications du kit
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| Stabilité des acides nucléiques des selles à température ambiante |
2 ans pour l'ADN, jusqu'à 7 jours pour l'ARN*
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*La stabilité de l'ARN varie en fonction des échantillons
Conditions de stockage et stabilité du produit
Lorsqu'ils sont conservés à température ambiante, les tubes de préservation des selles Norgen non utilisés sont stables jusqu'à la date de péremption sans aucune diminution de performance. Veuillez consulter la notice du dispositif ou l'étiquette du tube pour connaître la date de péremption.