Tubes de conservation ADN-cf/ARN-cf Dx
Pour le prélèvement de sang total et la préservation de l'ADN et de l'ARN circulants exempts de cellules
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Tubes de conservation ADN-cf/ARN-cf Dx
Pour le prélèvement de sang total et la préservation de l'ADN et de l'ARN circulants exempts de cellules
Aperçu du produit
Les tubes de conservation de l'ADN-cf/ARN-cf de Norgen sont des tubes en plastique fermés et sous vide destinés à la collecte et à la conservation de l'ADN-cf, de l'ADN tumoral circulant, de l'ADN-cf et des cellules tumorales qui circulent dans les échantillons de sang total humain pendant le stockage et l'expédition. L'utilisation de ces tubes en combinaison avec les kits de purification de l'ADN circulant sans cellules du plasma/sérum de Norgen ou les kits de purification de l'ARN du plasma/sérum de Norgen permet la purification et la concentration d'un ADNcf/ADNct/ARNcf sans inhibiteur dans un très petit volume d'élution. Le plasma récupéré dans les tubes de conservation ADN-cf/ARN-cf de Norgen est également compatible avec toute autre méthode de purification ADN-cf et/ou ARN-cf. L'ADN-cf, l'ADN-ct et l'ARN-cf purifiés sont compatibles avec toutes les applications en aval, y compris la PCR, la qPCR, la rt-qPCR, la PCR sensible à la méthylation, l'analyse par transfert de Southern, l'analyse de l'expression génique, les puces à ADN et la NGS.
Ce produit est destiné pour la collecte et préservation d'échantillon d'ADN-cf et d'ARN-cf pour des procédures de diagnostic pour des fins médicales.
Performance
Les tubes de conservation de l'ADN-cf/ARN-cf de Norgen facilitent le prélèvement/traitement du sang total en vue de la purification ultérieure de l'ADN-cf et/ou de l'ARN-cf. Les tubes conservateurs ADN-cf/ARN-cf préservent et inhibent la mort cellulaire programmée (apoptose) du sang, empêchant ainsi la libération de l'ADN/ARN intracellulaire dans le plasma. Les échantillons de sang total peuvent être expédiés et conservés à température ambiante en vue du traitement ultérieur du plasma. Les niveaux d'ADN-cf/ct et d'ARN-cf sont stables jusqu'à 30 jours à température ambiante. L'ADN-cf est également stable jusqu'à 8 jours à 37°C.
Détails
Données justificatives
Figure 1. Effet du stockage à température ambiante sur l'ADN cf (ADNp), illustré par le court fragment Alu (115 pb), et sur l'ADN génomique (ADNg), illustré par le grand fragment Alu (247 pb). Des échantillons de sang ont été prélevés dans l'une ou l'autre des deux catégories suivantes : 1) Tubes EDTA, 2) Tubes concurrents ou 3) Tubes conservateurs cf-DNA/cf-RNA de Norgen Dx et conservés à température ambiante. Des aliquotes de sang ont été prélevées aux moments indiqués et le plasma a été séparé. L'ADN a été isolé et les concentrations d'ADNp et d'ADNg ont été déterminées par PCR en temps réel en utilisant une cible courte du gène ALU (115 pb) représentant l'ADNp et un gène ALU long (247 pb) représentant l'ADNg. Les niveaux de ces deux fragments doivent rester les mêmes pendant la durée indiquant une stabilisation et l'absence d'hémolyse. Comme prévu, il n'y a pas eu de stabilisation de l'ADNcf et une hémolyse importante dans le tube EDTA. Le concurrent a montré des valeurs Ct significativement plus faibles pour les deux gènes après 14 jours, alors que l'ADN cf était stable pendant 30 jours à température ambiante pour les tubes de conservation ADN cf/ARN cf de Norgen Dx.
Figure 2. Pas de perte de volume plasmatique après expédition/transport. Le sang a été prélevé en double sur 6 donneurs différents. Une série a été conservée dans le laboratoire à température ambiante et l'autre a été emballée dans une boîte isolée et expédiée de Thorold, ON par fret aérien de nuit jusqu'à Winnipeg, MB, puis de nouveau jusqu'à Thorold, ON (temps écoulé 72 h). À leur retour, les échantillons conservés ont été stockés à température ambiante pendant 7 jours avant que le plasma ne soit séparé. Le volume de plasma récupéré dans les tubes de conservation cf-DNA/cf-RNA de Norgen Dx n'a pas changé avant ou après l'expédition (6 à 7 mL de plasma récupéré). Pour les tubes Competitor et les tubes EDTA, le volume de plasma récupéré avant expédition était de ~ 4 ml et après expédition de ~ 2,5 mL.
Figure 3. Hémolyse du sang prélevé mesurée dans le temps. Des échantillons de sang ont été prélevés dans : 1) Tubes EDTA, 2) Tubes concurrents et 3) Tubes conservateurs cf-DNA/cf-RNA de Norgen et conservés jusqu'à 30 jours. L'hémolyse a été déterminée en mesurant l'absorption de l'hémoglobine libre dans le plasma de 3 sujets à 414 nm sur plusieurs points dans le temps. L'absorption moyenne est indiquée. La quantité d'hémoglobine libre a augmenté rapidement avec chaque jour de stockage supplémentaire dans les tubes EDTA et les tubes Competitor, et est restée relativement constante dans les tubes de conservation cf-DNA/cf-RNA de Norgen Dx.
Figure 4. Prévenir la lyse cellulaire, la libération de l'ADNg et l'accumulation de l'échelle apoptotique dans le plasma. Échantillons de sang prélevés dans trois tubes différents (tubes de conservation cf-ADN/ARN-ARN de Norgen Dx, EDTA et Competitor) et stockés jusqu’à 30 jours. Les tubes conservateurs cf-DNA/cf-RNA de Norgen Dx permettent d'éviter la libération d'ADNg de haut poids moléculaire dans le plasma tout en minimisant l'accumulation d'échelle apoptotique contaminante provenant des leucocytes mourants du sang périphérique. Comme l'indique le cercle noir, la contamination par l'ADNg est très faible par rapport aux tubes concurrents et d'EDTA. Cela indique que les niveaux de lyse cellulaire sont très faibles et que l'ADNg est ensuite libéré dans l'échantillon de plasma préservé.
Figure 5. Effet du stockage à haute température (37°C) pendant 8 jours. Les échantillons de sang ont été prélevés dans des tubes d'EDTA, des tubes Competitor ou des tubes de conservation ADN-cf/ARN-cf de Norgen Dx et conservés à 37°C. L’ADN-cf a ensuite été isolé à partir du plasma traité. La concentration d'ADNg a été déterminée par PCR en temps réel en utilisant une cible longue du gène ALU (247 pb). L'ADNg - cible dans les tubes EDTA a montré une baisse significative de la valeur Ct. après 1 jour de stockage à 37°C par rapport au point de temps initial, et a continué à baisser jusqu'au 8ième jour de stockage. Pour le concurrent, l'ADNg - cible est resté stable jusqu'au 4ième jour de stockage, puis les valeurs Ct. ont commencé à chuter de manière significative, ce qui indique une faible stabilisation au-delà du 4ième jour. Les tubes de conservation ADN-cf/ARN-cf de Norgen Dx ont stabilisé les échantillons pendant 8 jours.
Figure 6. Grande quantité d'ADN-cf du plasma conservée à l'aide des tubes de conservation de l'ADNcf/ARN-cf de Norgen Dx. Des échantillons de sang du même donneur ont été prélevés dans des tubes Competitor ou dans des tubes de conservation ADN-cf/ARN-cf de Norgen Dx et conservés à température ambiante pendant 7 jours. Le tube de conservation ADN-cf/ARN-cf de Norgen Dx a permis de récupérer 6,5 mL de plasma, tandis que le tube du concurrent a permis de récupérer 3,5 mL de plasma. L'ADN-cf a ensuite été isolé à partir de l'ensemble du volume de plasma récupéré dans chaque tube à l'aide du kit Midi de purification de l'ADN circulant exempt de cellules du plasma/sérum de Norgen (Cat. 55600) et le kit Maxi de purification de l'ADN circulant exempt de cellules du plasma/sérum de Norgen (Cat. 55800). La quantité d’ADN récupérée à partir des deux échantillons a été évaluée à l’aide de la puce à ADN haute sensibilité du bioanalyseur Agilent. Comme le montre la trace du bioanalyseur, le tube de conservation de Norgen a produit plus d'ADNcf (pic bleu) que l'ADNcf récupéré dans le tube de conservation du concurrent.
Figure 7. Effet de la conservation à température ambiante sur l'ARNcf, illustré par le transcrit de l'ARNr 18S, le transcrit de l'ARNm HPRT1 et le miR-21. Des échantillons de sang ont été prélevés dans l'une ou l'autre des deux catégories suivantes : 1) Tubes de concurrents ou 2) Tubes de conservation d’ADN-cf/ARN-cf de Norgen Dx. Les tubes des concurrents ont été conservés à température ambiante pendant 14 jours, tandis que les tubes de conservation d’ADN-cf/ARN-cf de Norgen Dx ont été conservés pendant 30 jours à température ambiante. Aux moments indiqués, chaque tube a été traité et le plasma a été séparé. L'ARN-cf a été isolé et la stabilité de l'ARN-cf purifié a été déterminée par amplification rt-qPCR ciblant le transcrit de l'ARNr 18S, le transcrit de l'ARNm HPRT1 et le miR-21. Les niveaux de ces trois cibles devraient rester inchangés pendant la durée indiquant une stabilisation. Le concurrent a montré des valeurs Ct significativement plus élevées pour les trois cibles après 7 jours, indiquant une dégradation de l'ARN-cf, alors que l'ARN-cf est resté stable pendant 30 jours à température ambiante pour les tubes de conservation ADN-cf/ARN-cf de Norgen Dx.
Kit Specifications
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Tube Size
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16 x 100 mm
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Tube Type | PET Tube |
Blood Draw Volume
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8.4 mL in 10 mL Tubes
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Preservative Volume |
1.6 mL
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Recovered Plasma Volume | Approximately 6-7 mL (not affected by shipping) |
Anticoagulant |
Proprietary
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Preservative |
Non formaldehyde - Proprietary preservation agent
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Length of cf-DNA Preservation |
Up to 30 days at room temperature (15-25°C)
Up to 8 days at 37°C |
Length of cf-RNA Preservation |
Up to 30 days at room temperature (15-25°C)
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Length of CTCs Preservation |
Up to 14 days at room temperature (15-25°C)
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Storage Conditions and Product Stability
- When stored at 15-30°C, unfilled Norgen cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes Dx are stable through the expiration date. See tube label for expiry date.
- Short-term storage/shipping at -20°C to 37°C for up to 10 days is acceptable for unfilled Norgen cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes Dx.
- Do not freeze unfilled Norgen cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes Dx for long term storage over 10 days. Freezing unfilled tubes may lead to loss of vacuum and precipitation may occur.
- Cell-free DNA in blood samples collected in Norgen's cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes Dx is stable for up to 30 days when stored at room temperature (15-25°C)
- Cell-free DNA in blood samples collected in Norgen's cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes Dx is stable for up to 8 days when stored at 37ºC.
- Cell-free RNA in blood samples collected in Norgen's cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes Dx is stable for up to 30 days when stored at room temperature (15-25°C)
- Circulating tumor cells (CTCs) in blood samples collected in Norgen's cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes Dx are stable for up to 14 days at room temperature (15-25ºC).