粪便核酸采集和保存剂试管
快速、简单的粪便样本采集、保存和发送方法
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粪便核酸采集和保存剂试管
快速、简单的粪便样本采集、保存和发送方法
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概述
Norgen 的粪便核酸采集和保存剂试管专为快速保存新鲜粪便标本中的核酸而设计。粪便核酸采集和保存剂试管中含有液态的 Norgen 粪便保存剂。使用者只需将粪便采集到试管中(填满试管上的标线),然后轻轻搅拌,直到粪便完全浸没在保存剂中。粪便保存剂可防止革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌和真菌的生长,还能灭活病毒,从而使非感染性样本得到安全处理和运输。此外,粪便保存剂无需立即处理或冷冻样本,可在环境温度下将样本运送到集中检测设施。粪便保存剂的成分可使样本在室温下保存 2 年以上 (DNA) 和 7 天 (RNA)。为延长粪便 RNA 在保存剂中的稳定性,在 RNA 纯化之前,建议在运抵检测机构时储存在 -20°C 或 -70°C 温度下。
细节
支持数据
图 1.Norgen 的一流保护。14 天储存期内群落对稳定解决方案的反应变化汇总。按稳定液分组的每位患者与参照物的布雷-柯蒂斯距离。中位数和第 5 到第 95 个百分位数的范围显示的都是样本间和患者间的变异性(改编自 Plauzolles 等人,2022 年)。与其他 11 种样本采集和储存方法相比,Norgen 与冷冻粪便样本最为相似。
图 2.从保存的粪便样本中分离出的粪便总 DNA 和 RNA 的完整性。使用 Norgen 的粪便核酸分离试剂盒(类别号:45600),从室温下保存的 4 个不同供体(A 至 D 泳道)的 200 µL 粪便中分离出 DNA 和 RNA,并在指定的时间点(DNA 在 27 个月时,RNA 在 7 天时)进行保存。然后,将 75 µL 洗脱核酸中的 10 µL 加载到凝胶上进行目测分析。从室温下保存 27 个月的粪便样本中分离出高纯度粪便 DNA,从室温下保存 7 天的粪便样本中分离出高纯度 RNA。M 泳道是 Norgen 的 HighRanger 1 kb DNA 梯子(类别号:11900)。
图 3.使用 TaqMan 实时聚合酶链式反应检测法监测添加到保存的粪便样本中的腺病毒 (Ad5subE1) 的 DNA 稳定性。在保存的粪便样本中添加 6 x 109 pfu/mL 的腺病毒,并在指定时间点取出 200 µL 样本。然后使用 Norgen 的粪便 DNA 分离试剂盒(类别号:27600)分离粪便 DNA。然后,在 20 µL 聚合酶链式反应中使用每 50 µL 洗脱液中的 2 µL DNA 模板来检测腺病毒 DNA。研究表明,粪便保存剂可在环境温度下稳定腺病毒 DNA 长达 21 周,这表明 Norgen 的粪便核酸采集和保存剂试管是一种安全、方便的样本运输系统。
图 4.不同储存条件下粪便样本在门类层次上的分层聚类保存在 Norgens 粪便核酸采集和保存剂试管(类别号:45630、45660)在 2 天内与对照组(第 0 天的新鲜粪便,RT)没有明显差异,而未保存的粪便样本在树枝图中显示出与原始粪便剖面的距离。
图 5.与新鲜粪便(第 0 天)相比,门级前 5 大富集微生物的差异。在 RT 条件下保存 2 天后,保存粪便样本中的固氮菌、类杆菌和蛋白菌的丰度高于非保存 (NP) 的新鲜粪便样本,这表明保存粪便样本的微生物特征更接近于新鲜粪便样本(第 0 天)。
图 6.在 RT 条件下保存 2 天的保存和非保存粪便样本中细菌属的相对丰度。使用 Norgens 粪便核酸采集和保存剂试管(类别号:45630、45660)与新鲜粪便样本(第 0 天)呈封闭相关性。
图 7.使用 (A) 新鲜粪便(第 0 天)和在 RT 条件下保存 2 天的粪便以及 (B) 新鲜粪便(第 0 天)和在 RT 条件下保存 2 天的非保存粪便读取的重复细菌元基因组读数之间的相关性。新鲜粪便(第 0 天)和保存粪便的 R2 值更大,表明新鲜粪便样本和保存粪便样本的一致性更高。
试剂盒规格
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粪便输入
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2 克
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粪便核酸在室温下的稳定性 |
DNA 为 2 年,RNA 为 7 天*。
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* RNA 的稳定性因样本而异
储存条件和产品稳定性
所有试管都应密封保存,并在室温(15 - 25°C)下存放长达 2 年,其性能不会降低。
Purification and Detection of Bacterial RNA From Preserved Stool Samples - Application Note
Comparative Microbiome Profiles from Fecal Preservation Methods
Gut Microbiome Diversity: Comparison of Stool DNA Preservation Methods
Immediate Viral Inactivation Using Norgen’s Stool Nucleic Acid Preservative
Automation of Stool DNA Isolation on the Hamilton Vantage Using Norgen’s Magnetic Bead Stool Isolation Kit