总 RNA 纯化试剂盒 - 旋转柱
用于快速纯化总 RNA(包括 microRNA),无需使用苯酚
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总 RNA 纯化试剂盒 - 旋转柱
用于快速纯化总 RNA(包括 microRNA),无需使用苯酚
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概述
这些试剂盒适用于从一系列样本中分离总 RNA,包括细胞、细菌、酵母、病毒和体液(包括血浆/血清、血液、唾液、脑脊液等)。提取优质、高纯度的 RNA,其 RIN 值和 A260/A280 均非常出色,适用于 qRT-PCR、RT-PCR、微阵列、NGS 等下游应用。这些试剂盒可在同一馏分中纯化各种大小的 RNA,从大 mRNA、lncRNA 到 microRNA (miRNA),无需使用苯酚。以相同的速度分离所有 RNA 序列,而不论其大小。此外,当 RNA 序列较小(如 miRNA)时,无论其 GC 含量如何,色谱柱都能与小 RNA 结合。
细节
支持数据
图 1.分离的 RNA 质量高,大小范围全。与大多数竞争对手的试剂盒不同,Norgen 的总 RNA 纯化试剂盒可以分离所有大小的 RNA,从超大 RNA 到 microRNA,而无需使用苯酚。使用 Norgens 总 RNA 纯化试剂盒和竞争对手试剂盒从 1 x 109 个大肠杆菌细胞中分离出总 RNA。在琼脂糖凝胶(面板 A)和 Agilent® 2100 BioAnalyzer RNA Nano 6000 芯片(面板 B)上分别分析了从 50 µL 中分离出来的 5 µL 和 1 µL 的 RNA。注意通过 Norgen 试剂盒分离的样本中存在小 RNA(红色方框),而竞争对手 RNA 制备中不存在这些 RNA。
图 2.在同一提取物中同时扩增大分子和小分子 RNA。Norgen 的总 RNA 纯化试剂盒无需使用苯酚即可分离出完整大小范围的 RNA,包括小 RNA。使用 Norgen 总 RNA 纯化试剂盒、各种硅胶竞争剂和苯酚 TRI 试剂从 75 万个 HeLa 细胞中分离出总 RNA。RT-PCR 按照 Shi 和 Chiang(2005 年)的方法进行。从 50 µL 中分离出来的 15 µL 的 RNA 在 50 µL Poly-(A)-Polymerase 反应中进行多聚腺苷酸化。在 20 µL 的反转录反应中使用了 4 µL 多聚腺苷酸化的 RNA,并使用了 poly T 适应子引物。在 20 µL q 聚合酶链式反应中使用了 1 µL 的反转录产物,并使用了针对人类 microRNA(miR-19 和 miR-21)和大 mRNA(S15)的引物。只有使用 Norgen 的总 RNA 纯化试剂盒才能检测到 microRNA 和 mRNA 扩增产物,与竞争对手 2 的试剂盒类似,但不使用苯酚。
图 3.从各种输入中获得优质 RNA。Norgen 的总 RNA 纯化试剂盒可从多种物种或组织类型中分离 RNA。使用 Norgen 总 RNA 纯化试剂盒从 5 x 108 个大肠杆菌细胞、1 x 106 个 HeLa 细胞、100 µL 大鼠血液和 10 mg 仓鼠肾脏中分离出总 RNA。在 Agilent® 2100 生物分析仪上使用 RNA Nano 6000 芯片对从 50 µL 中分离出来的 1 µL 的 RNA 进行分析。注意所有输入的 RNA 都是完整的,但存在小 RNA 物种。Norgen 的总 RNA 纯化试剂盒能从 RIN 值在 8 到 10 之间的各种输入物中持续分离出优质 RNA。
图 4.极大的隔离灵敏度。Norgen 的总 RNA 纯化试剂盒可从单个细胞中灵敏提取 RNA。从 293 HEK 细胞(从 100 万个细胞到单个细胞)中提取总 RNA。然后用寡聚 dT 引物对从 50 µL 中分离出来的 5 µL 的 RNA 进行 20 µL 反转录。在 20 µL 聚合酶链式反应中使用了 3 µL 反转录液和引物,以检测人 β 肌动蛋白转录本。只要一个细胞就能检测到 β 肌动蛋白的聚合酶链式反应产物。M 是标记泳道。
图 5.线性、灵敏地分离大分子和小分子 RNA。Norgens 总 RNA 纯化试剂盒可从不同的输入量中稳定地分离出大 RNA 和小 RNA。使用 Norgen 的总 RNA 纯化试剂盒(蓝色)、基于竞争对手硅胶的试剂盒(绿色)和基于苯酚的 RNA 提取方法(红色)从 10 到 100,000 个 HeLa 细胞中分离出总 RNA。通过总 RNA 样本的 RT-qPCR 测定 miR-21(A 组)和 S15(B 组)的相对表达。简言之,从 50 µL 分离的 RNA 中取 1 µL ,使用 miR-21 茎环反向引物或 oligo dT 引物进行 20 µL 反转录。在 20 µL 实时聚合酶链式反应中使用了 2 µL 的反转录产物和引物,以检测人类 miR-21(A 组)和 S15 转录物(B 组)。得出的阈值周期 (Ct) 值与输入细胞数相对应。对于大 RNA (S15) 和小 RNA (miR-21),使用 Norgen 总 RNA 纯化技术分离的 RNA 具有最佳的线性度(R2 较高)和灵敏度(Ct 较低)。
图 6.从血浆中有效、一致地检测 miRNA。Norgen 的总 RNA 纯化试剂盒能有效地从血浆中分离 miRNA。使用 Norgen 的总 RNA 纯化试剂盒(蓝色)、基于竞争对手硅胶的试剂盒(绿色)和基于苯酚的 RNA 提取方法(红色),从 50、100 或 200 µL 大鼠血浆中分离出总 RNA,每次分离三份。使用 miR-21 的特异性引物进行了干环 RT-q 聚合酶链式反应。简言之,从 50 µL 分离出的 RNA 中取 2 µL ,使用 miR-21 茎环反向引物或 oligo dT 引物进行 20 µL 反转录。在 20 µL 的实时聚合酶链式反应中使用了 3 µL 的反转录产物和引物来检测人类 miR-21。Norgen 的总 RNA 纯化试剂盒是唯一能显示 (1) 在所有输入量下都能一致检测到 miR-21 转录本,以及 (2) Ct 值与输入量相关(输入量增加,Ct 值降低)的产品。
图 7.以更好的一致性从血浆中回收多种 miRNA。Norgen 的总 RNA 纯化试剂盒分离出的血浆 RNA 在微阵列等下游应用中表现更稳定。使用 Norgen 的总 RNA 纯化试剂盒、竞争对手 1 的主要 miRNA 试剂盒或基于苯酚的 RNA 提取方法,从 100 µL 小鼠血浆中分离出包括 miRNA 在内的总 RNA,一式两份。每个试剂盒提取的 100 ng RNA 被用于 Illumina microRNA 表达谱分析试剂盒。散点图显示 Norgen 样本的重复信号具有更好的一致性(更好的聚类)。两次重复中 Pval 均小于 0.01 的基因用蓝色表示。相关表格显示,Norgen 的方案恢复了同样多样性的 miRNA,而且一致性更好(r2值更高)。
图 8.从血浆中检测到的 miRNA 更具多样性。Norgen 的总 RNA 纯化试剂盒能从血浆中分离出 miRNA,其多样性优于主要竞争对手。使用 Norgen 的总 RNA 纯化试剂盒从 100 µL 的血浆中分离出包括 miRNA 的总 RNA,或使用竞争对手 A 的领先 miRNA 试剂盒从 625 µL 的血浆中分离出总 RNA,并将其应用于 NCode 表达谱分析试剂盒。微阵列图像显示,与竞争对手的 miRNA 试剂盒(右图)相比,Norgen 的总 RNA 纯化试剂盒(左图)能从较少的血浆输入量中分离出更多样的 miRNA。图片由休斯顿 LC Sciences 提供。
图 9.利用 Illumina Small RNA 下一代测序技术提高从 HeLa 细胞中检测到的 miRNA 的多样性。Norgen 的总 RNA 纯化试剂盒能从 HeLa 细胞中分离出 miRNA,其多样性优于主要竞争对手。使用 Norgen 的总 RNA 纯化试剂盒和 竞争对手 Q 的领先 miRNA 试剂盒从 100 万个 HeLa 细胞中分离出包括 miRNA 在内的总 RNA,并将其应用于 MiSeq 测序仪上的 Illumina Small RNA 下一代测序。面板 A 显示,诺健总 RNA 纯化试剂盒回收的 miRNA 数量高于竞争对手。特别是,在不使用苯酚的情况下,只需 20 分钟的 RNA 样本制备时间,就能以更快、更简单的程序实现更高的多样性。B 组是检测到的 miRNA 平均 RPM(百万读数)散点图,用于比较 Norgen 和竞争对手试剂盒的 miRNA 回收率。Norgens 总 RNA 纯化试剂盒回收的具有较高 RPM 的 miRNA 数量明显较多,如插图和面板 C 所示。
图 10.无需使用苯酚,即可获得稳定的优质 RNA,且大小范围齐全。Norgen 的总 RNA 纯化 96 孔试剂盒可以稳定地分离出优质 RNA,从超大 RNA 到小 RNA,粒度齐全,无需使用苯酚。使用 Norgen 的总 RNA 纯化 96 孔试剂盒,从大肠杆菌(约 5 x108个细胞/mL)过夜培养物的 0.5 mL 等分样本中分离总 RNA,重复 16 次。在 1.2% 甲醛琼脂糖凝胶上从 75 µL 中分离出来的 5 µL 的 RNA。所有 16 个重复均显示出高产和优质。此外,所有重复均显示有效回收了所有大小的 RNA,包括小 RNA(箭头)。
图 11.从各种输入中获得优质 RNA。Norgen 的总 RNA 纯化 96 孔试剂盒可从多种物种和组织类型中分离 RNA。使用 Norgen 总 RNA 纯化 96 孔试剂盒从 8 mg 脑组织(A 泳道)、肾组织(B 泳道)、肝组织(C 泳道)、肺组织(D 泳道)和脾组织(E 泳道)、7.5 x105 HeLa 细胞(F 泳道)和 CHO 细胞(G 泳道)以及 5 x108个细菌(H 泳道)中分离总 RNA。在 1.2% 甲醛琼脂糖凝胶上从 75 µL 中分离出来的 5 µL 的 RNA。通过观察甲醛-琼脂糖凝胶可以看出,Norgen 试剂盒可用于从多种类型的样本中成功分离总 RNA,包括小 RNA 物种。
图 12.大 RNA 和小 RNA 的分离。Norgen 的总 RNA 纯化 96 孔试剂盒可以稳定地分离大 RNA 和小 RNA。使用 Norgen 的总 RNA 纯化 96 孔试剂盒从 5 x105 个 HeLa 细胞样本中分离出总 RNA。然后将每个总 RNA 样本的等分样本用于 2 个不同的 RT-q 聚合酶链式反应。用 miR-21 茎环反向引物或 oligo dT 对从 75 µL 中分离出来的 10 µL 的 RNA 进行 20 µL 反转录。在 20 µL 的实时聚合酶链式反应中使用 3 µL 的反转录物,引物分别用于检测人类 miR-21(A 组)和 S15 转录本(B 组)。所有样本的 mRNA 和 microRNA 扩增结果一致,Ct 值的变异性较低。因此,使用该试剂盒可以持续分离出这两种类型的 RNA。
图 13.极高的隔离灵敏度Norgen 的总 RNA 纯化试剂盒可从少于 10 个细胞中灵敏提取 RNA。使用 Norgen 的总 RNA 纯化 96 孔试剂盒,用 RT-qPCR 检测从不同输入量的 HeLa 细胞(从 100,000 个细胞到单个细胞)中分离出来的 mRNA。然后用寡聚 dT 引物对从 75 µL 中分离出来的 10 µL 的 RNA 进行 20 µL 反转录。在 20 µL 的实时聚合酶链式反应中使用了 3 µL 的反转录物,并使用引物检测人类 S15 转录本。得出的 Ct 值与输入的细胞数相对应。从单个 HeLa 细胞中分离并线性检测总 RNA。
试剂盒规格
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最大结合能力
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高达 50 μg RNA
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最大装载量
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650 μL
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纯化的 RNA 大小
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所有大小,包括小 RNA(< 200 nt)
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起始材料的最大用量
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动物细胞 | 3 x 106 个细胞 |
动物组织 | 10 mg (适用于大多数组织* |
血液 | 100 μL |
血浆/血清 | 200 μL |
细菌 | 1 x 109 个细胞 |
酵母 |
1 x 108 个细胞
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真菌 |
50 mg
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植物组织 |
50 mg
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完成 10 次净化所需的时间 |
20 分钟
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平均产量 | |
HeLa 细胞 (1 x 106 个细胞) | 15 μg |
大肠杆菌 (1 x 109 个细胞) | 50 μg |
* 如需从大量组织中分离总 RNA,请使用 Norgen 的动物组织 RNA 纯化试剂盒(类别号:25700)
储存条件和产品稳定性
所有溶液都应密封保存在室温下。这些试剂盒自发货之日起 2 年内保持稳定。
(37500) Total RNA Purification Kit (Spin Column) - Protocol (100 prep)
(17250) Total RNA Purification Kit (Spin Column) - Protocol (250 prep)
(17270) Total RNA Purification Kit (Spin Column) - Protocol (500 prep)
(24300) Total RNA Purification 96-Well Kit (High Throughput) - Protocol (96-well) - (2 x 96-well plates)
(24370) Total RNA Purification 96-Well Kit (High Throughput) - Protocol (96-well) - (6 x 96-well plates)
(24350) Total RNA Purification 96-Well Kit (High Throughput Deep Well) - Protocol (Deep Well) - (2 x 96-well plates)
(24380) Total RNA Purification 96-Well Kit (High Throughput Deep Well) - Protocol (Deep Well) - (6 x 96-well plates)
Supplementary Protocol for Total RNA Isolation from Staphylococcus aureus-Related Bacteria and Hard-to-Lyse Bacterial Species
Isolation of RNA from Norgen’s Swab Collection and Total Nucleic Acid Preservation System
Supplementary Protocol - Norgen's Saliva RNA Collection and Preservation Devices
Supplementary Protocol for Isolating Viral RNA from Swab Samples
Supplementary Protocol - Total RNA Isolation From Cerebrospinal Fluid Csf
Isolation of True Total RNA using the Tempus™ Blood RNA Tube and Norgen’s Total RNA Purification Kit
Effect of RNA Isolation Method on microRNA Quantity and Quality in Plasma: A Comparative Study
Revised Guidelines for RNA Quality Assessment for Diverse Biological Sample Input
Total RNA/DNA Purification and Detection from Blood Preserved on a Neoteryx™ Mitra Microsampling Device
Effect of microRNA GC Content on RNA Purification Efficiency
Substrate Specificity of Taq Polymerase - ASCB 2007
Genomic Profiling of Hepatitis B Virus and Hepatitis C Virus From 1 mL of Urine - ASM 2007
Silicon Carbide As A Novel RNA Affinity Medium With Improved Sensitivity and Size Diversity - microRNA 2008
Effect of RNA Isolation Methods On microRNA Quantity and Quality In Plasma - TriCon 2013
The Impact of Sample Preparation On Microrna Quality and Diversity For Downstream Applications - microRNA 2009
Rapid and qPCR ready DNA isolation from environmental and human bodily fluid samples using Magnetic bead system