细胞质/核 RNA 纯化
用于从培养的细胞和组织中纯化细胞质和核 RNA
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细胞质/核 RNA 纯化
用于从培养的细胞和组织中纯化细胞质和核 RNA
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概述
该试剂盒提供了一种从培养的动物细胞和小型组织样本中分离和纯化细胞质和细胞核 RNA 的快速方法。该试剂盒可用于从细胞质和核 RNA 分馏物中分离各种大小的 RNA,包括所有小 RNA 物种,无需使用苯酚。 试剂盒中的试剂足以制备 50 份细胞质 RNA 或 25 份细胞质 RNA 和 25 份细胞核 RNA。 处理 10 个样本大约需要 45 分钟。该试剂盒还提供 100 份预处理规格。
背景
在某些情况下,最好能分离分馏 RNA 而不是总 RNA。例如,在某些表达谱分析研究中,最好只分离成熟的细胞质 RNA。另外,为了调查和研究预处理(未剪接)的 RNA,分离核 RNA 也是可取的。此外,该试剂盒还可用于分离 RNA,以用于需要避免 DNA 污染的下游应用,因为细胞质部分已被证明不含任何基因组 DNA 痕迹。
细节
支持数据
图 1.有效分离 HeLa 细胞的细胞质与核 RNA。Norgen 的细胞质和核 RNA 纯化试剂盒用于从 0.75 万个 HeLa 细胞中有效分离细胞质和核 RNA,每次分离三份。A 组:使用 Norgen 试剂盒纯化了优质细胞质和细胞核 RNA。注意细胞质和细胞核 RNA 的完整性和质量。在 1.5% 甲醛-琼脂糖凝胶上运行每 50 µL 洗脱液中的 10 µL。M 泳道为 Norgen 的 1 kb RNA 梯,1-3 道为核 RNA,4-6 泳道为细胞质 RNA。B 组:用 Norgen 试剂盒从 HeLa 细胞中分离出 10 μL 上述细胞质和细胞核 RNA,然后在 0.9% 琼脂糖 DNA 凝胶上检测。核 RNA 产物(1-3 泳道)中可以清楚地看到基因组 DNA,但在细胞质 RNA 产物(4-6 泳道)中检测不到基因组 DNA。请注意,我们提供了可选的柱上 DNase 处理方案,以去除核馏分中的基因组 DNA。
图 2.超强分离 HeLa 细胞的细胞质和核 RNA。与竞争对手的主要产品相比,Norgen 的细胞质和核 RNA 纯化试剂盒能更好地从 0.8 百万 HeLa 细胞中分离出细胞质和核 RNA。A 组:使用 Norgen 试剂盒和竞争对手的试剂盒从 HeLa 细胞中纯化的细胞质和细胞核 RNA。在 1.5% 甲醛-琼脂糖凝胶上分别取 10 µL 细胞质(C)或细胞核(N)RNA 的 50 µL 洗脱液(Norgen 或竞争对手试剂盒)。使用 Norgen 试剂盒分离出的 RNA 产率更高,完整性更好。B 组:用 Norgen 试剂盒和竞争对手试剂盒从 HeLa 细胞中分离出 10 μL 的细胞质和细胞核 RNA,在 0.9% 琼脂糖凝胶上检测。基因组 DNA 只与使用诺健细胞质与核 RNA 纯化试剂盒分离的 RNA 中的核部分发生共迁移,而不与细胞质部分发生共迁移。请注意,我们提供了可选的柱上 DNase 处理方案,以去除核馏分中的基因组 DNA。与此相反,使用竞争对手试剂盒分离的 RNA 的细胞质部分出现了严重的基因组 DNA 污染。
图 3.不含基因组 DNA 的细胞质 RNA。使用 Norgen 的细胞质与核 RNA 纯化试剂盒从 100 万个 HeLa 细胞中分离出 50 µL 的细胞质 RNA,使用人β 肌动蛋白引物对其中的 2 µL 进行 RT-PCR 扩增。M 泳道是 Norgen 的聚合酶链式反应Sizer DNA 梯子,泳道 1 和 3 是阴性对照(仅 PCR,无反向转录),2 和 4 泳道是实际 RT-PCR,显示预期的 166 bp RT-PCR 产物。基因拷贝的预期扩增片段大小与 RNA 转录本相同。1 和 3 泳道中没有产物,说明分离的细胞质 RNA 中没有基因组 DNA 污染。所有聚合酶链式反应产物均在 1X TAE、2% 琼脂糖凝胶上分离。
图 4.细胞质和核转录本的特异性分离和后续扩增。Norgen 的细胞质和核 RNA 纯化试剂盒能有效分离细胞质和核 RNA。使用 Norgen 的细胞质与核 RNA 纯化试剂盒从 100 万个 HeLa 细胞中分离出 0.5 µg 的细胞质或核 RNA 产物,使用人 U2 snRNA(A 组)或 S14(B 组)引物进行 RT-PCR。在面板 A 中,当使用核特异性 U2 snRNA 引物时,仅在核部分观察到强烈的聚合酶链式反应产物。在 B 组中,在细胞质部分观察到了 S14 的看家转录本的大部分聚合酶链式反应产物。这两项结果表明,使用 Norgen 的细胞质和核 RNA 纯化试剂盒可以有效分离细胞质和核 RNA。所有聚合酶链式反应产物均在 1X TAE、1.5% 琼脂糖 DNA 凝胶上分离。
试剂盒规格
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最大色谱柱结合能力
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高达 50 µg RNA
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最大色谱柱装载量
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650 µL
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纯化的 RNA 大小
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所有大小,包括小 RNA(< 200 nt)
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完成 10 次净化所需时间 |
45 分钟
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RNA 产量
HeLa (1 x 106) - 细胞质 RNA HeLa (1 x 106) - 核 RNA |
15 µg ≤ 3.5 µg |
储存条件和产品稳定性
所有溶液都应密封保存在室温下。该试剂盒自发货之日起 2 年内保持稳定。