Para la extracción de sangre entera y la conservación de ADN y ARN circulantes libres de células
Tubos conservantes de cf-ADN/cf-ARN
Para la extracción de sangre entera y la conservación de ADN y ARN circulantes libres de células
Register today to receive an exclusive 15% off* on your first order.
Descripción general del producto
Los tubos conservantes de cf-ADN/cf-ARN de Norgen son tubos de plástico cerrados y evacuados para la recogida y conservación de cf-ADN, cf-ADN tumoral circulante, cf-ARN y células tumorales circulantes en muestras de sangre entera humana durante su almacenamiento y envío. El uso de estos tubos en combinación con los kits de purificación de ADN circulante libre de células en plasma/suero de Norgen o los kits de purificación de ARN en plasma/suero de Norgen permite la purificación y concentración de un cf-ADN/ct-ADN/cf-ARN libre de inhibidores en un volumen de elución muy pequeño. El plasma recuperado de los tubos conservantes de cf-ADN/cf-ARN de Norgen también es compatible con cualquier otro método de purificación de cf-ADN y/o cf-ARN. El cf-ADN, ct-ADN y cf-ARN purificados son compatibles con cualquier ensayo de aplicación posterior, incluyendo PCR, qPCR, rt-qPCR, PCR sensible a la metilación, análisis Southern Blot, análisis de expresión génica, microarrays y NGS.
Este producto es exclusivamente para uso en investigación y no para uso en procedimientos de diagnóstico.
Rendimiento
Los tubos conservantes de cf-ADN/cf-ARN de Norgen simplifican la extracción/procesamiento de sangre entera para la posterior purificación de cf-ADN y/o cf-ARN. Los tubos conservantes cf-DNA/cf-RNA preservan e inhiben la muerte celular programada (apoptosis) de la sangre, evitando así la liberación de ADN/ARN intracelular al plasma. Las muestras de sangre entera pueden enviarse y almacenarse a temperatura ambiente para el posterior procesamiento del plasma. Los niveles de cf/ct ADN y cf-ARN son estables hasta 30 días a temperatura ambiente. El cf-ADN también es estable hasta 8 días a 37°C. Cuando la sangre recogida en los tubos de cf-ADN/cf-ARN de Norgen se procesa para la recuperación de plasma, no se generará capa leucocitaria y las células tumorales circulantes (CTC) se localizarán en el fondo del tubo con el sedimento sanguíneo. Las CTC son estables durante 14 días a temperatura ambiente, donde pueden extraerse del sedimento sanguíneo o de la sangre entera conservada para la clasificación celular o para la purificación de cf/ADN o cf-ARN.
Las muestras de plasma producidas a partir de la muestra de sangre total recogida en los tubos conservantes de cf-ADN/ cf-ARN de Norgen y purificadas utilizando los kits de purificación de ADN circulante libre de células en plasma/suero de Norgen o los kits de purificación de ARN en plasma/suero de Norgen producen cf-ADN/ct-ADN o cf-ARN concentrado, de alta calidad y libre de inhibidores para cualquier aplicación posterior.
Detalles
Supporting Data
Figure 1. Effect of ambient temperature storage on cf-DNA (pDNA), exemplified by the short Alu (115bp) fragment, and genomic DNA (gDNA), exemplified by the large Alu (247 bp) fragment.
Blood samples were drawn into either: 1) EDTA tubes, 2) Competitor tubes or 3) Norgen's cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes and stored at room temperature. Aliquots of blood were removed at the indicated times and the plasma was separated. DNA was isolated, and pDNA and gDNA concentrations were determined by real-time PCR using a short ALU gene target (115 bp) representing the pDNA and a long ALU gene (247 bp) representing the gDNA. Levels of these two fragments should stay the same for the duration indicating stabilization and no hemolysis. As expected, there was no stabilization of cf-DNA and extensive hemolysis in the EDTA tube. Competitor showed significantly lower Ct values for both genes after 14 days, whereas cf-DNA was stable for 30 days at room temperature for Norgen's cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes.
Figure 2. No plasma volume loss after shipping/transportation.
Blood was drawn from 6 different donors in duplicate. One set was kept in the lab at room temperature and the other was packed in an insulated box and shipped from Thorold, ON via overnight air freight to Winnipeg, MB and then back to Thorold ON (elapsed time 72 h). Upon return, preserved samples were stored at room temperature for 7 days before plasma was separated. The plasma volume recovered from Norgen's cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes did not change before shipping or after shipping (6-7 mL recovered plasma). For both Competitor tubes and EDTA tubes the plasma volume recovered before shipping was ~ 4 mL and after shipping was ~ 2.5 mL.
Figure 3. Hemolysis of collected blood measured over time.
Blood samples were drawn into: 1) EDTA tubes, 2) Competitor tubes and 3) Norgen's cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes and stored for up to 30 days. Hemolysis was determined by measuring the absorption of free hemoglobin in plasma from 3 subjects at 414 nm over several time points. Mean absorption is shown. The amount of free hemoglobin increased rapidly with each additional storage day in the EDTA tubes and Competitor tubes, and remained relatively constant in Norgen's cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes.
Figure 4. Prevent cell lysis and the release of gDNA and accumulation of apoptotic ladder in plasma.
Blood samples drawn into three different tubes (Norgen's cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes, EDTA, and Competitor) and stored for up to 30 days. Norgen's cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes helps prevent the release of high molecular weight gDNA into plasma while also minimizing the accumulation of contaminating apoptotic ladder from dying peripheral blood leukocytes. As indicated in the black circle, gDNA contamination is at a very low level as compared to both the Competitor and EDTA tubes. This is indicative of very low levels of cell lysis and subsequent release of gDNA into the preserved plasma sample.
Figure 5. Effect of high temperature (37°C) storage for 8 days.
Blood samples were drawn into either EDTA tubes, Competitor tubes or Norgen's cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes and stored at 37°C. cf-DNA was then isolated from processed plasma. gDNA concentration was determined by real-time PCR using a long ALU gene target (247 bp). The gDNA - target in EDTA tubes showed a significant drop in the Ct. value after 1 day of storage at 37°C compared to the initial time point, and continued to drop until the 8th day of storage. For Competitor, the gDNA - target remained stable up to the 4th day of storage and then the Ct. values started to significantly drop, indicating poor stabilization beyond day 4. Norgen's cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes stabilized samples for 8 days.
Figure 6. High Quantity of cf-DNA from Plasma preserved using Norgen's cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes.
Blood samples from the same donor were drawn into either Competitor tubes or Norgen's cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes and stored at room temperature for 7 days. Norgen's cf-DNA/cf-RNA preservative Tube recovered 6.5mL plasma whereas the Competitor's tube recovered 3.5mL plasma. The cf-DNA was then isolated from the entire plasma volume recovered from each tube using Norgen's Plasma/Serum Cell-Free Circulating DNA Purification Midi Kit (Cat. 55600) and Norgen's Plasma/Serum Cell-Free Circulating DNA Purification Maxi Kit (Cat. 55800). The quantity of DNA recovered from both samples were assessed using the Agilent Bio-analyzer High Sensitivity DNA Chip. As can be seen in the bioanalyzer trace, Norgen's preservative tube yielded more cf-DNA (Blue peak) as compared to the cf-DNA recovered from the Competitor's preservative tube.
Figure 7. Effect of ambient temperature storage on cf-RNA, exemplified by the 18S rRNA transcript, HPRT1 mRNA transcript and miR-21.
Blood samples were drawn into either: 1) Competitor tubes or 2) Norgen's cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes. Competitor’s tubes were stored at room temperature for 14 days whereas Norgen’s cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes were stored for 30 days at room temperature. At the indicated times each tube was processed and the plasma was separated. Cf-RNA was isolated and the stability of the purified cf-RNA was determined by rt-qPCR amplification targeting the 18S rRNA transcript, HPRT1 mRNA transcript and miR-21. Levels of these three targets should stay the same for the duration indicating stabilization. Competitor showed significantly higher Ct values for the three targets after 7 days indicating cf-RNA degradation, whereas cf-RNA was stable for 30 days at room temperature for Norgen's cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes.
Figure 8. Effect of ambient temperature storage on plasma protein preservation for 30 days.
Blood samples were drawn into Norgen's cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes and were stored for 30 days at room temperature. At the indicated times each tube was processed for plasma recovery and proteins were purified from 50 µL plasma using Norgen’s ProteoSpin™ Abundant Serum Protein Depletion Kit (Cat. 17300) . The stability of the purified A) depleted – plasma proteins and B) highly abundant plasma proteins was evaluated on a 12% SDS-PAGE Gel. Both the depleted – plasma proteins and the highly abundant plasma proteins were found to be stable for 30 days at ambient temperature without any sign of protein degradation.
Datos de respaldo
Figura 1. Efecto del almacenamiento a temperatura ambiente sobre el cf-ADN (pADN), ejemplificado por el fragmento corto Alu (115 pb), y el ADN genómico (ADNg), ejemplificado por el fragmento grande Alu (247 pb). Las muestras de sangre se extrajeron en: 1) Tubos EDTA, 2) Tubos de la competencia o 3) Tubos conservantes cf-DNA/cf-RNA de Norgen y almacenados a temperatura ambiente. Se extrajeron alícuotas de sangre en los momentos indicados y se separó el plasma. Se aisló el ADN y se determinaron las concentraciones de ADNp y ADNg mediante PCR en tiempo real utilizando un gen diana ALU corto (115 pb) que representaba el ADNp y un gen ALU largo (247 pb) que representaba el ADNg. Los niveles de estos dos fragmentos deben permanecer iguales durante todo el tiempo, lo que indica estabilización y ausencia de hemólisis. Como era de esperar, no hubo estabilización del cf-ADN y se produjo una hemólisis extensa en el tubo EDTA. El competidor mostró valores Ct significativamente más bajos para ambos genes después de 14 días, mientras que el cf-ADN fue estable durante 30 días a temperatura ambiente para los tubos conservadores de cf-ADN/cf-ADN de Norgen.
Figura 2. Sin pérdida de volumen plasmático tras el envío/transporte. Se extrajo sangre de 6 donantes diferentes por duplicado. Un juego se conservó en el laboratorio a temperatura ambiente y el otro se embaló en una caja aislante y se envió desde Thorold, ON, por transporte aéreo nocturno hasta Winnipeg, MB, y de vuelta a Thorold, ON (tiempo transcurrido: 72 h). A su regreso, las muestras conservadas se almacenaron a temperatura ambiente durante 7 días antes de separar el plasma. El volumen de plasma recuperado de los tubos conservadores de cf-ADN/cf-ADN de Norgen no cambió antes del envío ni después del envío (6-7 mL de plasma recuperado). Tanto para los tubos de la competencia como para los tubos EDTA, el volumen de plasma recuperado antes del envío fue de ~ 4 mL y después del envío fue de ~ 2,5 mL.
Figura 3. Hemólisis de la sangre recogida medida a lo largo del tiempo. Se extrajeron muestras de sangre en: 1) Tubos EDTA, 2) Tubos de la competencia y 3) Tubos conservantes cf-DNA/cf-RNA de Norgen y almacenados hasta 30 días. La hemólisis se determinó midiendo la absorción de la hemoglobina libre en el plasma de 3 sujetos a 414 nm durante varios puntos temporales. Se muestra la absorción media. La cantidad de hemoglobina libre aumentó rápidamente con cada día adicional de almacenamiento en los tubos EDTA y en los tubos de la competencia, y se mantuvo relativamente constante en los tubos conservadores cf-ADN/cf-ADN de Norgen.
Figura 4. Impiden la lisis celular y la liberación de ADNg y la acumulación de la escalera apoptótica en el plasma. Muestras de sangre extraídas en tres tubos diferentes (tubos conservadores de cf-ADN/cf-ARN de Norgen, EDTA y competencia) y almacenadas hasta 30 días. Los tubos conservantes cf-ADN/cf-ARN de Norgen ayudan a prevenir la liberación de gADN de alto peso molecular en el plasma a la vez que minimizan la acumulación de la escalera apoptótica contaminante de los leucocitos moribundos de sangre periférica. Como se indica en el círculo negro, la contaminación por gADN es muy baja en comparación con los tubos de la competencia y EDTA. Esto es indicativo de niveles muy bajos de lisis celular y la subsiguiente liberación de gADN en la muestra de plasma conservada.
Figura 5. Efecto del almacenamiento a alta temperatura (37°C) durante 8 días. Las muestras de sangre se extrajeron en tubos EDTA, tubos de la competencia o tubos conservantes de cf-ADN/ cf-ADN de Norgen y se almacenaron a 37°C. A continuación, se aisló el cf-ADN del plasma procesado. La concentración de gADN se determinó mediante PCR en tiempo real utilizando una diana larga del gen ALU (247 pb). El gADN - diana en tubos EDTA mostró un descenso significativo del valor Ct.después de 1 día de almacenamiento a 37°C en comparación con el punto temporal inicial, y continuó descendiendo hasta el 8º día de almacenamiento. Para la competencia, el gADN - diana permaneció estable hasta el 4º día de almacenamiento y después los valores Ct. empezaron a caer significativamente, indicando una pobre estabilización más allá del 4º día. Los tubos conservantes de cf-ADN/cf-ADN de Norgen estabilizaron las muestras durante 8 días.
Figura 6. Alta cantidad de cf-ADN de plasma conservado utilizando los tubos conservantes cf-ADN/cf-ADN de Norgen. Las muestras de sangre del mismo donante se extrajeron en tubos Competitor o en tubos conservantes cf-ADN/cf-ARN de Norgen y se almacenaron a temperatura ambiente durante 7 días. El tubo conservador cf-ADN/cf-ARN de Norgen recuperó 6,5 mL de plasma mientras que el tubo de la competencia recuperó 3,5 mL de plasma. A continuación, se aisló el cf-ADN de todo el volumen de plasma recuperado de cada tubo utilizando el kit de purificación de ADN circulante libre de células en plasma/suero Midi de Norgen (Cat. 55600) y el kit de purificación de ADN circulante libre de células en plasma/suero Maxi de Norgen (Cat. 55800). La cantidad de ADN recuperado de ambas muestras se evaluó utilizando el chip Agilent Bio-analyzer High Sensitivity DNA. Como puede observarse en el trazado del bioanalizador, el tubo con conservante de Norgen produjo más cf-ADN (pico azul) que el cf-ADN recuperado del tubo con conservante de la competencia.
Figura 7. Efecto del almacenamiento a temperatura ambiente sobre el cf-ARN, ejemplificado por el transcrito 18S rRNA, el transcrito HPRT1 mRNA y miR-21. Las muestras de sangre se extrajeron en: 1) Tubos de la competencia o 2) Tubos conservadores de cf-ADN/cf-ADN de Norgen. Los tubos de la competencia se almacenaron a temperatura ambiente durante 14 días, mientras que los tubos conservadores de cf-ADN/cf-ADN de Norgen se almacenaron durante 30 días a temperatura ambiente. A las horas indicadas se procesó cada tubo y se separó el plasma. Se aisló el cf-ARN y se determinó la estabilidad del cf-ARN purificado mediante amplificación rt-qPCR dirigida al transcrito del 18S ARNr, el transcrito del ARNm HPRT1 y miR-21. Los niveles de estos tres objetivos deben permanecer invariables mientras dure la estabilización. El competidor mostró valores Ct significativamente más altos para las tres dianas después de 7 días, indicando la degradación del cf-ARN, mientras que el cf-ARN se mantuvo estable durante 30 días a temperatura ambiente para los tubos conservantes de cf-ARN/cf-ARN de Norgen.
Figura 8. Efecto del almacenamiento a temperatura ambiente en la conservación de proteínas plasmáticas durante 30 días. Las muestras de sangre se extrajeron en tubos conservadores de cf-ADN/cf-ADN de Norgen y se almacenaron durante 30 días a temperatura ambiente. A las horas indicadas se procesó cada tubo para la recuperación de plasma y se purificaron proteínas de 50 µL de plasma utilizando el kit de agotamiento de proteínas séricas abundantes ProteoSpin™ de Norgen (Cat. 17300) . La estabilidad de las proteínas plasmáticas purificadas A) agotadas y B) altamente abundantes se evaluó en un gel SDS-PAGE al 12 %. Tanto las proteínas plasmáticas agotadas como las proteínas plasmáticas altamente abundantes resultaron ser estables durante 30 días a temperatura ambiente sin ningún signo de degradación proteica.
|
Especificaciones del kit
|
|
|
Tamaño del tubo
|
16 x 100 mm
|
| Tipo de tubo | PET Tube |
|
Volumen de extracción de sangre
|
8.7 ml en tubos de 10 ml
|
| Volumen del conservante |
1.3 mL
|
| Volumen de plasma recuperado | Aproximadamente 6-7 ml (no se ve afectado por el transporte) |
| Anticoagulante |
Patentado
|
| Conservante |
Sin formaldehído - Conservante patentado
|
|
Duración de la conservación del cf-ADN |
Hasta 30 días a temperatura ambiente (15-25°C),
Hasta 8 días a 37°C |
|
Duración de la conservación del cf-ARN |
Hasta 30 días a temperatura ambiente (15-25°C)
|
|
Duración de la conservación de CTCs |
Hasta 14 días a temperatura ambiente (15-25°C)
|
Condiciones de almacenamiento y estabilidad del producto
- Cuando se almacenan a 15-30°C, los tubos conservantes de cf-ADN/cf-ARN de Norgen sin rellenar son estables hasta la fecha de caducidad. Consulte la fecha de caducidad en la etiqueta del tubo.
- El almacenamiento/envío a corto plazo entre -20°C y 37°C durante un máximo de 10 días es aceptable para los tubos conservantes de cf-ADN/cf-ARN de Norgen sin rellenar.
- No congele los tubos conservantes de cf-ADN/cf-ADN de Norgen sin llenar para un almacenamiento a largo plazo superior a 10 días. La congelación de los tubos sin llenar puede provocar una pérdida de vacío y precipitaciones.
- El ADN libre de células de las muestras de sangre recogidas en los tubos conservantes de cf-ADN/cf-ADN de Norgen es estable hasta 30 días si se almacena a temperatura ambiente (15-25°C).
- El ADN libre de células de las muestras de sangre recogidas en los tubos conservantes de cf-ADN/cf-ADN de Norgen es estable hasta 8 días cuando se almacena a 37ºC.
- El ARN libre de células de las muestras de sangre recogidas en los tubos conservantes de cf-ADN/cf-ARN de Norgen es estable hasta 30 días si se almacena a temperatura ambiente (15-25°C).
- Las células tumorales circulantes (CTC) en muestras de sangre recogidas en los tubos conservantes de cf-DNA/cf-RNA de Norgen son estables hasta 14 días a temperatura ambiente (15-25ºC).
Documentation
- in a timely manner that considers the person's accessibility needs due to disability; and
- at a cost that is no more than the regular cost charged to other persons